在组织学实验室中，水无处不在。它用于水浴，浮浴以及实验室中存在的大多数自动化仪器（染色机，组织处理器等）中。质量差的水可能会生成硬质沉积物或细菌生物膜，从而可能干扰这些仪器的正常运行。此外; 由于水是组织学实验室制备的许多试剂的主要成分，因此水污染物可能会干扰zui终载玻片的质量。
组织学中使用了许多不同的染色剂，每种都有独特的特性。不幸的是，文献中没有具体描述可能干扰每种类型污渍的特定污染物。因此，大多数组织技术人员在解决染色问题时都依赖偶然性和经验。另外，组织学程序涉及自来水，去离子水或蒸馏水的使用，这使人们对选择哪种类型的水感到困惑。
水的质量可能会影响试剂质量和染色过程。劣质的水可能导致污渍沉淀（如银色污渍），或降低其化学稳定性。染色反应基于各种基本化学反应，例如酸碱化学或氧化还原。因此，可能会干扰这些反应的化学污染物可能会改变染色质量。zui终染色可能更浅，或者相反，可能会有更高的背景或非特异性结合。也可能获得错误的颜色或特异性。
使用纯净水可以可靠地降低水污染物干扰染色过程的风险，并确保染色机和组织处理器正常工作。
以下水污染物可能会影响组织学：
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自来水中经常存在的氯会对各种类型的污渍产生漂白作用。
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众所周知，诸如钙和各种金属之类的离子会干扰各种污渍（银污渍等）。例如，如果水中的氯化物含量过高，则会形成AgCl沉淀物。
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有机物：如果水中含有大量有机分子和其他营养物，细菌和霉菌可能会在水浴和组织漂浮浴，染色机和组织处理器管内部以及溶液中生长，并可能在载玻片上产生伪影。
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细菌：用于水浴和制备溶液的水应避免细菌污染。细菌及其副产物可能会粘附在组织切片上，并在载玻片上产生伪影。
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颗粒：用于水浴和制备溶液的水应不含颗粒。颗粒材料可能粘附在组织部分上，并在载玻片上产生伪影。它们还可能在仪表管线内形成沉积物并改变其功能。
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硬度和二氧化硅：水硬度和二氧化硅可能会在染色机和组织处理器的内部形成沉积物并改变其功能。这些水污染物也可能沉积在组织和载玻片上。
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pH值：尽管严格意义上讲pH值不是水污染物，但由于存在不同的水污染物，它可能会发生变化。某些污渍对pH高度敏感，例如阿尔辛蓝或三色。通过尽可能减少水中离子和有机酸的含量，可以使水的pH值保持在7附近。
